STINGRAY specifications

Information


Unique identifier OMICS_14537
Name System for Integrate Genomic Resources and Analyses
Interface Web user interface
Restrictions to use License purchase required
Input data Nucleotide or protein sequences
Input format FASTA
Programming languages Perl
License GNU General Public License version 2.0
Computer skills Basic
Version 2.0
Stability Beta
Maintained Yes

Maintainer


  • person_outline Alberto Davila <>

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Unique identifier OMICS_14537
Name System for Integrate Genomic Resources and Analyses
Software type Pipeline/Workflow
Interface Command line interface
Restrictions to use License purchase required
Input data Nucleotide or protein sequences
Input format FASTA
Operating system Unix/Linux
Programming languages Perl
License GNU General Public License version 2.0
Computer skills Advanced
Stability Stable
Requirements Apache, MySQL
Maintained Yes

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STINGRAY institution(s)
Laboratório de Biologia Computacional e Sistemas, Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; Laboratório de Protozoologia, Departamento de Microbiologia, Imunologia e Parasitologia (MIP), Centro de Ciências Biológicas (CCB), Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), Santa Catarina, Brazil; Laboratório de Doenças Infecciosas e Parasitárias (LDIP), Área de Ciências Biológicas e da Saúde (ACBS), Universidade do Oeste de Santa Catarina (Unoesc), Santa Catarina, Brazil; Pólo de Biologia Computacional e Sistemas, Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, Brazil; Laboratório de Biologia Molecular de Parasitas e Vetores, Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, Brazil; Laboratório de Genética Molecular de Microrganismos, Instituto Oswaldo Cruz (IOC), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, Brazil; Laboratório de Bioinformática, Instituto Carlos Chagas (ICC), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Paraná, Brazil; Instituto Militar de Engenharia (IME), Seção de Engenharia de Computação (SE-8), Rio de Janeiro, Brazil; Instituto de Matemática, Departamento de Ciência da Computação, Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil; Instituto Alberto Luiz Coimbra de Pós-graduação e Pesquisa de Engenharia (COPPE), Universidade Federal do Rio de Janeiro, Rio de Janeiro, Brazil
STINGRAY funding source(s)
This project was funded by the CNPq, the FAPERJ and the CAPE.

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