TarSeqQC specifications

Information


Unique identifier OMICS_20070
Name TarSeqQC
Software type Application/Script
Interface Command line interface
Restrictions to use None
Operating system Unix/Linux, Mac OS, Windows
Programming languages R
License GNU General Public License version 2.0
Computer skills Advanced
Version 1.10.0
Stability Stable
Requirements
methods, stats, plyr, graphics, BiocGenerics, IRanges, GenomicRanges, utils, S4Vectors, GenomeInfoDb, Biostrings, grDevices, GenomicAlignments, ggplot2, BiocParallel, RUnit, reshape2, Hmisc, cowplot, openxlsx, R(>=3.4.1), Rsamtools(>=1.20.4)
Maintained Yes

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Documentation


Maintainers


  • person_outline Elmer Andres Fernandez <>
  • person_outline Gabriela Merino <>

Publication for TarSeqQC

TarSeqQC institution(s)
UA AREA CS. AGR. ING. BIO. Y S, CONICET, Universidad Católica de Córdoba, Córdoba, Argentina; Facultad de Ciencias Exactas, Físicas y Naturales, Universidad Nacional de Córdoba, Córdoba, Argentina; Fundación Instituto Leloir and Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires-CONICET, Buenos Aires, Argentina; Intergrupo Argentino para el Tratamiento de los Tumores Gastrointestinales, Buenos Aires, Argentina; Hospital de Gastroenterología “Dr. Carlos Bonorino Udaondo”, Buenos Aires, Argentina
TarSeqQC funding source(s)
Supported by Argentine grants from the Universidad Católica de Córdoba (BOD/2016), Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva (FONCYT PPL06/2011, FONCYT PPL04/2011, and FONARSEC PBIT 015/13), Secretaría de Ciencia y Tecnología-Universidad Nacional de Córdoba (30720150101719CB) and the Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET).

TarSeqQC reviews

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